Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- conda [2018/10/23 09:49] – luc
+++ conda [2022/03/26 20:41] (Version actuelle) – luc
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+====== CONDA ======
+Conda est un gestionnaire de paquets python similaire à pip, mais spécialisé dans les paquets scientifiques. En effet, un certain nombre de ces bibliothèques comportent des parties en C qu'il faut compiler, et pip n'est pas forcément à l'aise avec la chose.
+===== Commandes utiles de Conda =====
+<code bash>
+# lister les environnement
+conda info --envs
+# créer et détruire un environnement
+conda create -n <envs> (python=3.7.1)
+conda remove -n <envs> --all  # supprimer tous les paquets de l'environnement
+# activer et désactiver un environnement (WINDOWS)
+activate <env>
+deactivate
+# activer et désactiver un environnement (LINUX)
+conda activate <env>
+conda deactivate
+# lister les paquets installés dans un environnement (qd celui-ci est activé)
+conda list
+# installer/supprimer un paquet dans un environnement
+conda install bokeh
+conda remove bokeh
+# mettre à jour tous les paquets d'un environnement
+conda update --all
+conda update bokeh
+# Vider le cache de conda
+conda clean --all   # Remove unused packages and caches
+</code>
+===== Configuration sous linux =====
+conda, livré sous le format miniconda, propulse sa propre version d’interpréteur python. Pour ne pas pourrir sa distribution linux, il est conseillé de faire un peu attention. Eviter les export  /path-to-miniconda/bin et autres choses dans le genre, ça écraserait le lien vers le python système dans les consoles.
+A la place, on peut rajouter une ligne dans bashrc :
+<code bash>
+# ~/.bashrc
+. /path-to-miniconda/etc/profile.d/conda.sh
+</code>
+Cela executera le code contenu dans le script visé, et dans notre cas activera la commande conda dans un environnement adéquat.
+Note : valable si le shell est bash..
+===== Conda et jupyter =====
+Pour que les environnements conda soient gérables depuis l'interface jupyter (et la découverte de ceux-ci par jupyter ?), il faut installer nb_conda et nb_conda__kernels dans l'environnement base (celui d'où on execute jupyter)
+<code bash>
+conda activate base
+conda install nb_conda
+</code>
+Et pour qu'un environnement soit visible dans jupyter, il faut installer dans celui-ci le packet ipykernel
+<code bash>
+conda activate myenv
+conda install ipykernel
+</code>
+=== Extensions ===
+Il existe des extensions sympa à jupyter, comme la Table Of Content.
+Pour installer le gestionnaire d'extension :
+<code bash>
+conda install -c conda-forge jupyter_contrib_nbextensions
+</code>